北川羌族人群57个常染色体InDel位点的遗传多态性及群体遗传结构分析

蒋春月, 马浩, 范庆炜, 杨慧凌, 徐冬冬, 王韵, 杜冰

Analysis of Genetic Polymorphism and Population Genetic Structure of 57 Autosomal InDel Loci in Beichuan Qiang Population

Chun-yue JIANG, Hao MA, Qing-wei FAN, Hui-ling YANG, Dong-dong XU, Yun WANG, Bing DU

表3 北川羌族人群57个A-InDel位点的等位基因频率及群体遗传学参数

Tab. 3 Allele frequencies and population genetic parameters of 57 A-InDels in Beichuan Qiang population

位点 Fdel Fins DP Ho He PIC PEduo PEtrio Fst rs34421865 0.452 5 0.547 5 0.632 1 0.475 0 0.496 7 0.372 7 0.122 8 0.279 8 0.062 3 rs3076465 0.432 5 0.567 5 0.602 5 0.525 0 0.492 1 0.370 4 0.120 5 0.278 4 0.111 7 rs34287950 0.580 0 0.420 0 0.625 9 0.470 0 0.488 4 0.368 5 0.118 7 0.277 2 0.216 2 rs151335218 0.515 0 0.485 0 0.638 2 0.470 0 0.500 8 0.374 8 0.124 8 0.281 1 0.038 8 rs5787309 0.517 5 0.482 5 0.571 1 0.585 0 0.500 6 0.374 7 0.124 7 0.281 1 0.094 2 rs67405073 0.577 5 0.422 5 0.587 5 0.545 0 0.489 2 0.368 9 0.119 1 0.277 5 0.092 7 rs60867863 0.507 5 0.492 5 0.627 4 0.495 0 0.501 1 0.374 9 0.124 9 0.281 2 0.236 1 rs71852971 0.695 0 0.305 0 0.581 8 0.410 0 0.425 0 0.334 1 0.089 9 0.256 4 0.210 7 rs769299 0.385 0 0.615 0 0.616 2 0.460 0 0.474 7 0.361 4 0.112 1 0.272 9 0.040 0 rs10590825 0.497 5 0.502 5 0.659 0 0.405 0 0.501 2 0.375 0 0.125 0 0.281 2 0.018 1 rs79225518 0.540 0 0.460 0 0.643 1 0.450 0 0.498 0 0.373 4 0.123 4 0.280 2 0.164 1 rs140683187 0.635 0 0.365 0 0.602 2 0.470 0 0.464 7 0.356 1 0.107 4 0.269 7 0.025 7 rs57981446 0.520 0 0.480 0 0.613 6 0.520 0 0.500 5 0.374 6 0.124 6 0.281 0 0.196 4 rs145191158 0.512 5 0.487 5 0.622 2 0.505 0 0.500 9 0.374 8 0.124 8 0.281 2 0.192 4 rs10626599 0.570 0 0.430 0 0.624 6 0.480 0 0.491 4 0.370 1 0.120 1 0.278 2 0.007 8 rs112879447 0.512 5 0.487 5 0.585 9 0.565 0 0.500 9 0.374 8 0.124 8 0.281 2 0.010 7 rs10607699 0.320 0 0.680 0 0.587 9 0.430 0 0.436 3 0.340 5 0.094 7 0.260 3 0.009 9 rs35309403 0.385 0 0.615 0 0.612 2 0.470 0 0.474 7 0.361 4 0.112 1 0.272 9 0.082 0 rs145577149 0.622 5 0.377 5 0.610 7 0.465 0 0.471 2 0.359 5 0.110 4 0.271 7 0.059 6 rs113011930 0.485 0 0.515 0 0.608 2 0.530 0 0.500 8 0.374 8 0.124 8 0.281 1 0.250 3 rs35453727 0.562 5 0.437 5 0.624 4 0.485 0 0.493 4 0.371 1 0.121 1 0.278 8 0.127 8 rs5897566 0.325 0 0.675 0 0.591 4 0.430 0 0.439 8 0.342 5 0.096 3 0.261 5 0.182 2 rs1160980 0.587 5 0.412 5 0.643 7 0.405 0 0.485 9 0.367 2 0.117 5 0.276 4 0.042 8 rs77206391 0.502 5 0.497 5 0.617 2 0.515 0 0.501 2 0.375 0 0.125 0 0.281 2 0.184 5 rs35464887 0.560 0 0.440 0 0.582 4 0.560 0 0.494 0 0.371 4 0.121 4 0.279 0 0.034 7 rs67100350 0.395 0 0.605 0 0.616 6 0.470 0 0.479 1 0.363 7 0.114 2 0.274 3 0.137 9 rs538690481 0.635 0 0.365 0 0.609 8 0.450 0 0.464 7 0.356 1 0.107 4 0.269 7 0.150 5 rs67939200 0.565 0 0.435 0 0.644 2 0.430 0 0.492 8 0.370 7 0.120 8 0.278 6 0.056 3 rs66739142 0.460 0 0.540 0 0.593 1 0.550 0 0.498 0 0.373 4 0.123 4 0.280 2 0.117 7 rs3217112 0.417 5 0.582 5 0.623 0 0.475 0 0.487 6 0.368 1 0.118 3 0.277 0 0.065 3 rs59841142 0.492 5 0.507 5 0.636 5 0.475 0 0.501 1 0.374 9 0.124 9 0.281 2 0.171 3 rs145010051 0.530 0 0.470 0 0.628 1 0.490 0 0.499 4 0.374 1 0.124 1 0.280 7 0.430 2 rs66477007 0.332 5 0.667 5 0.595 1 0.435 0 0.445 0 0.345 4 0.098 5 0.263 2 0.203 0 rs142221201 0.370 0 0.630 0 0.574 9 0.530 0 0.467 4 0.357 5 0.108 7 0.270 5 0.058 0 rs67426579 0.482 5 0.517 5 0.631 6 0.485 0 0.500 6 0.374 7 0.124 7 0.281 1 0.158 2 rs145941537 0.332 5 0.667 5 0.602 9 0.405 0 0.445 0 0.345 4 0.098 5 0.263 2 0.038 0 rs67365630 0.485 0 0.515 0 0.608 2 0.530 0 0.500 8 0.374 8 0.124 8 0.281 1 0.072 3 rs3064355 0.585 0 0.415 0 0.635 2 0.440 0 0.486 8 0.367 7 0.117 9 0.276 7 0.004 2 rs60564093 0.387 5 0.612 5 0.615 4 0.465 0 0.475 9 0.362 0 0.112 7 0.273 2 0.018 5