北川羌族人群57个常染色体InDel位点的遗传多态性及群体遗传结构分析
|
|
蒋春月, 马浩, 范庆炜, 杨慧凌, 徐冬冬, 王韵, 杜冰
|
Analysis of Genetic Polymorphism and Population Genetic Structure of 57 Autosomal InDel Loci in Beichuan Qiang Population
|
|
Chun-yue JIANG, Hao MA, Qing-wei FAN, Hui-ling YANG, Dong-dong XU, Yun WANG, Bing DU
|
|
表4 27个人群的Nei’s遗传距离
|
Tab. 4 Nei’s genetic distance of 27 populations
|
|
| 人群 | Qiang | CDX | CHB | CHS | JPT | KHV | BEB | GIH | ITU | PTL | STU | ACB | ASW | ESN | GWD | LWK | MSL | YRI | CLM | MXL | PEL | PUR | CEU | FIN | GBR | IBS | TSI |
|---|
| Qiang | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | | CDX | 0.011 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | | CHB | 0.004 | 0.011 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | | CHS | 0.005 | 0.008 | 0.005 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | | JPT | 0.009 | 0.015 | 0.008 | 0.010 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | | KHV | 0.010 | 0.006 | 0.011 | 0.007 | 0.016 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | | BEB | 0.067 | 0.071 | 0.064 | 0.066 | 0.076 | 0.067 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | | GIH | 0.080 | 0.084 | 0.077 | 0.081 | 0.092 | 0.080 | 0.009 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | | ITU | 0.069 | 0.075 | 0.068 | 0.071 | 0.082 | 0.068 | 0.007 | 0.008 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | | PTL | 0.079 | 0.080 | 0.076 | 0.080 | 0.088 | 0.077 | 0.009 | 0.005 | 0.006 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | | STU | 0.070 | 0.072 | 0.070 | 0.070 | 0.081 | 0.066 | 0.009 | 0.009 | 0.005 | 0.008 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | | ACB | 0.177 | 0.179 | 0.174 | 0.176 | 0.179 | 0.175 | 0.097 | 0.091 | 0.113 | 0.103 | 0.114 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | | ASW | 0.161 | 0.164 | 0.158 | 0.161 | 0.166 | 0.158 | 0.082 | 0.074 | 0.095 | 0.086 | 0.095 | 0.005 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | | ESN | 0.191 | 0.194 | 0.189 | 0.191 | 0.195 | 0.190 | 0.117 | 0.109 | 0.135 | 0.124 | 0.136 | 0.003 | 0.008 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | | GWD | 0.195 | 0.197 | 0.193 | 0.193 | 0.197 | 0.191 | 0.127 | 0.116 | 0.144 | 0.134 | 0.142 | 0.018 | 0.019 | 0.015 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | | LWK | 0.185 | 0.184 | 0.184 | 0.185 | 0.188 | 0.182 | 0.111 | 0.102 | 0.126 | 0.118 | 0.125 | 0.005 | 0.007 | 0.005 | 0.017 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | | MSL | 0.186 | 0.189 | 0.186 | 0.187 | 0.192 | 0.183 | 0.116 | 0.110 | 0.133 | 0.125 | 0.132 | 0.005 | 0.008 | 0.005 | 0.014 | 0.005 | | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | | YRI | 0.194 | 0.195 | 0.191 | 0.193 | 0.193 | 0.192 | 0.115 | 0.108 | 0.133 | 0.124 | 0.134 | 0.003 | 0.008 | 0.003 | 0.015 | 0.004 | 0.005 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | | CLM | 0.092 | 0.095 | 0.086 | 0.093 | 0.100 | 0.091 | 0.023 | 0.019 | 0.027 | 0.021 | 0.029 | 0.066 | 0.052 | 0.082 | 0.095 | 0.078 | 0.084 | 0.082 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | | MXL | 0.075 | 0.072 | 0.066 | 0.073 | 0.076 | 0.067 | 0.030 | 0.031 | 0.034 | 0.028 | 0.035 | 0.105 | 0.089 | 0.121 | 0.133 | 0.116 | 0.124 | 0.123 | 0.017 | - | - | - | - | - | - | - | - | | PEL | 0.072 | 0.070 | 0.065 | 0.073 | 0.070 | 0.066 | 0.068 | 0.078 | 0.071 | 0.069 | 0.071 | 0.159 | 0.144 | 0.175 | 0.184 | 0.170 | 0.177 | 0.178 | 0.047 | 0.021 | - | - | - | - | - | - | - | | PUR | 0.108 | 0.109 | 0.102 | 0.107 | 0.116 | 0.104 | 0.023 | 0.016 | 0.025 | 0.017 | 0.028 | 0.064 | 0.050 | 0.080 | 0.095 | 0.075 | 0.083 | 0.081 | 0.009 | 0.024 | 0.070 | - | - | - | - | - | - | | CEU | 0.134 | 0.138 | 0.125 | 0.134 | 0.145 | 0.128 | 0.034 | 0.024 | 0.036 | 0.024 | 0.038 | 0.087 | 0.069 | 0.105 | 0.120 | 0.102 | 0.108 | 0.107 | 0.019 | 0.039 | 0.096 | 0.010 | - | - | - | - | - | | FIN | 0.131 | 0.134 | 0.121 | 0.130 | 0.137 | 0.127 | 0.038 | 0.029 | 0.040 | 0.026 | 0.042 | 0.084 | 0.069 | 0.103 | 0.120 | 0.098 | 0.105 | 0.102 | 0.022 | 0.042 | 0.095 | 0.014 | 0.010 | - | - | - | - | | GBR | 0.137 | 0.140 | 0.127 | 0.138 | 0.149 | 0.134 | 0.033 | 0.022 | 0.034 | 0.022 | 0.037 | 0.091 | 0.073 | 0.111 | 0.127 | 0.106 | 0.113 | 0.112 | 0.019 | 0.043 | 0.102 | 0.012 | 0.004 | 0.009 | - | - | - | | IBS | 0.129 | 0.133 | 0.122 | 0.130 | 0.142 | 0.127 | 0.029 | 0.019 | 0.030 | 0.020 | 0.035 | 0.081 | 0.064 | 0.098 | 0.116 | 0.096 | 0.103 | 0.100 | 0.015 | 0.037 | 0.094 | 0.008 | 0.005 | 0.011 | 0.004 | - | - | | TSI | 0.136 | 0.138 | 0.128 | 0.135 | 0.146 | 0.131 | 0.033 | 0.022 | 0.034 | 0.022 | 0.037 | 0.083 | 0.068 | 0.103 | 0.119 | 0.100 | 0.105 | 0.103 | 0.020 | 0.042 | 0.101 | 0.010 | 0.005 | 0.012 | 0.006 | 0.005 | - |
|
|
|