利用COⅠ基因鉴别长三角地区常见嗜尸性蝇类

doi:10.12116/j.issn.1004-5619.2020.400611

摘要/Abstract

摘要： 目的

利用线粒体细胞色素c氧化酶亚基Ⅰ（cytochrome c oxidase subunit Ⅰ， COⅠ）基因序列对长三角地区常见嗜尸性蝇类物种进行分子鉴定并验证其可靠性。

方法

于野外放置的大型家猪尸体上采集并经实验室多代培养、遗传稳定的长三角地区常见嗜尸性蝇类共3科6属7个物种，提取全基因组DNA后扩增COⅠ基因片段，正反向测序后拼接，通过Mega 7.0.26等软件分析扩增片段的碱基组成和种间进化分歧率，并采用邻接（neighbor joining， NJ）法和非加权组平均法（unweighted pair-group method with arithmetic means， UPGMA）构建长三角地区常见嗜尸性蝇类COⅠ基因序列的系统发育树。

结果

不同蝇类物种的平均碱基组成为A（30.14%）、T（38.23%）、C（15.98%）、G（15.65%）。种间进化分歧率在2.2%~15.3%，最低在大头金蝇和肥躯金蝇之间，最高在厩腐蝇和棕尾别麻蝇之间。

结论

利用COⅠ基因能够较好地鉴别长三角地区的常见嗜尸性蝇类物种。

关键词: 法医昆虫学, 细胞色素c氧化酶亚基Ⅰ, 种属鉴别, 嗜尸性蝇类, 长三角地区

Abstract: Objective

To identify the common sarcosaprophagous flies in the Yangtze River Delta based on mitochondrial cytochrome c oxidase subunit Ⅰ（COⅠ） gene sequence and verify the reliability of this method.

Methods

Seven common genetically stable sarcosaprophagous flies in three families and six genera were collected from large domestic pig carcasses placed in the field and cultured in the laboratory for many generations. The whole genome DNA was extracted and the COⅠ gene fragment was amplified. The forward and reverse sequencing was followed by splicing. The base composition of the amplified fragment and the rate of interspecific evolutionary divergence were analyzed by software such as Mega 7.0.26. The phylogenetic tree of COⅠ gene sequence of common necrophagous flies in the Yangtze River Delta was established by neighbor joining （NJ） method and unweighted pair-group method with arithmetic means （UPGMA） method.

Results

The average base composition of different flies was A（30.14%）, T（38.23%）, C（15.98%）, G（15.65%）. The rate of interspecific evolutionary divergence ranged from 2.2% to 15.3%, the lowest rate was between Chrysomya megacephala and Chrysomya pinguis, the highest rate was between Muscina stabulans and Boettcherisca peregrina.

Conclusion

COⅠ gene can be used to identify the common necrophagous flies in the Yangtze River Delta.

Key words: forensic entomology, cytochrome c oxidase subunit Ⅰ, species identification, sarcosaprophagous flies, Yangtze river delta

中图分类号:

DF795.1

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图/表 4

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科	属	种	拉丁名
丽蝇科	金蝇属	大头金蝇	Chrysomya megacephala
		肥躯金蝇	Chrysomya pinguis
	裸金蝇属	绯颜裸金蝇	Chrysomya rufifacies
	阿丽蝇属	巨尾阿丽蝇	Chrysomya grahami
	绿蝇属	丝光绿蝇	Lucilia sericata
麻蝇科	别麻蝇属	棕尾别麻蝇	Boettcherisca peregrina
蝇科	厩腐蝇属	厩腐蝇	Muscina stabulans

科	属	种	拉丁名
丽蝇科	金蝇属	大头金蝇	Chrysomya megacephala
		肥躯金蝇	Chrysomya pinguis
	裸金蝇属	绯颜裸金蝇	Chrysomya rufifacies
	阿丽蝇属	巨尾阿丽蝇	Chrysomya grahami
	绿蝇属	丝光绿蝇	Lucilia sericata
麻蝇科	别麻蝇属	棕尾别麻蝇	Boettcherisca peregrina
蝇科	厩腐蝇属	厩腐蝇	Muscina stabulans

蝇类	大头金蝇	绯颜裸金蝇	巨尾阿丽蝇	厩腐蝇	棕尾别麻蝇	丝光绿蝇
大头金蝇	-
绯颜裸金蝇	6.5	-
巨尾阿丽蝇	8.7	9.7	-
厩腐蝇	12.4	14.0	11.5	-
棕尾别麻蝇	13.6	13.6	14.6	15.3	-
丝光绿蝇	9.2	11.5	7.2	10.8	12.6	-
肥躯金蝇	2.2	7.7	9.2	12.4	14.2	9.7

蝇类	大头金蝇	绯颜裸金蝇	巨尾阿丽蝇	厩腐蝇	棕尾别麻蝇	丝光绿蝇
大头金蝇	-
绯颜裸金蝇	6.5	-
巨尾阿丽蝇	8.7	9.7	-
厩腐蝇	12.4	14.0	11.5	-
棕尾别麻蝇	13.6	13.6	14.6	15.3	-
丝光绿蝇	9.2	11.5	7.2	10.8	12.6	-
肥躯金蝇	2.2	7.7	9.2	12.4	14.2	9.7

蝇类	A	T	C	G	A+T	C+G
大头金蝇	30.40	38.45	15.35	15.81	68.85	31.15
绯颜裸金蝇	30.55	38.16	15.65	15.65	68.71	31.29
巨尾阿丽蝇	30.85	37.99	15.96	15.20	68.84	31.16
厩腐蝇	29.03	38.45	16.72	15.81	67.48	32.52
棕尾别麻蝇	29.33	37.69	17.02	15.96	67.02	32.98
丝光绿蝇	30.55	39.06	15.05	15.35	69.61	30.39
肥躯金蝇	30.24	37.84	16.11	15.81	68.08	31.92
均值	30.14	38.23	15.98	15.65	68.37	31.63