法医学杂志 ›› 2013, Vol. 29 ›› Issue (6): 419-424.DOI: 10.3969/j.issn.1004-5619.2013.06.005
岳阳阳1,2,赵贵森1,2,张 倩1,鲁 涤2,翟仙敦1,莫耀南1
YUE YANG-YANG1,2, ZHAO GUI-SEN1,2, ZHANG QIAN1, LU DI2, ZHAI XIAN-DUN1, MO YAO-NAN1
摘要: 目的 建立单管一步甲基化可变位点(methylation variable position,MVP)分析技术——单管消化后PCR链融解曲线分析(post-digestion PCR-melting curve analysis,PDP-MCA)。 方法 以文献报道的差异甲基化区(differentially methylated region,DMR)为模型,在MVP两侧设计一组解链温度各不相同的引物。应用FastDigest甲基化敏感性限制酶(methylation-sensitive restriction enzyme,MSRE),在同一反应管内顺次进行DNA的酶切、复合扩增和MCA检测,生成MCA图谱。同时用该方法和传统的MSRE-PCR MCA技术检测相同样品(外周静脉血、精液、阴道液各5份),比较两种方法检测结果,验证其可行性,并分析比较不同样品的MCA/HRM图谱。 结果 解链温度相差2 ℃以上的片段,MCA峰分离良好,复合扩增后可以用MCA技术检测。应用单管PDP-MCA技术,可以集酶切、扩增和检测三步于一管,在2 h内得到与传统方法一致的特异性图谱和数据,并实现样品的快速分类鉴别。 结论 单管PDP-MCA技术可以实现多个MVP的单管、闭管检测,具有简便、快速、易于自动化等优点,可用于样品DNA甲基化差异的检测。
中图分类号: