法医学杂志 ›› 2010, Vol. 26 ›› Issue (6): 446-448.DOI: 10.3969/j.issn.1004-5619.2010.06.012

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采用SNP分型方法对甲醛固定组织进行个体识别

林  源,李  莉,柳  燕,赵珍敏   

  1. (司法部司法鉴定科学技术研究所 上海市法医学重点实验室,上海 200063)
  • 发布日期:2010-12-25 出版日期:2010-12-28
  • 通讯作者: 通信作者:李莉,女,硕士,研究员,硕士研究生导师,主要从事法医物证学科研、检案与教学工作;E-mail:anneinchina@163.com
  • 作者简介:林源(1964—),男,上海人,副研究员,主要从事法医物证学鉴定;E-mail:liny@ssfjd.cn
  • 基金资助:

    中央级科研院所社会公益研究专项项目(GY0803)

SNP Typing of Formalin-fixed Tissue in Individual Identification

LIN YUAN, LI LI, LIU YAN, ZHAO ZHEN-MIN   

  1. (Shanghai Key Laboratory of Forensic Medicine, Institute of Forensic Science, Ministry of Justice, P.R.China, Shanghai 200063, China)
  • Online:2010-12-25 Published:2010-12-28

摘要: 目的 通过对X染色体SNP遗传标记的检测,探讨甲醛固定组织块的DNA分型策略。 方法 提取甲醛固定组织块的DNA,在用SinofilerTM试剂盒、MiniFilerTM试剂盒检测未能获得分型结果的情形下,采用多重PCR和飞行质谱技术对X染色体上的51个SNP位点进行分型检测。 结果 对于常染色体STR、miniSTR分型失败的甲醛固定组织块,X-SNP分型获得成功。 结论 对于甲醛固定组织块等微量、降解的生物学检材,若常染色体STR基因座分型失败,可尝试进行SNP位点的分型,以获得更多的遗传信息。

关键词: 法医遗传学, 多态性, 单核苷酸, 甲醛, 个体识别

Abstract: Objective To explore the method for DNA typing in formalin-fixed tissue by detecting SNP markers on X chromosome. Methods Genomic DNA was prepared from formalin-fixed tissue. In the event that typing using SinofilerTM and MiniFilerTM kits had failed, 51 SNPs were amplified with multiplex PCR and typed with matrix-assisted laser desorption/ionization-time of flight mass spectrometry(MALDI-TOF MS). Results Full profiles of X-SNP loci were obtained from the formalin-fixed tissue, while the STR and miniSTR genotyping failed. Conclusion SNP genotyping technique can be used to obtain more information for formalin fixed tissues.

Key words: forensic genetics, polymorphism, single nucleotide, formaldehyde, individual identification

中图分类号: