法医学杂志 ›› 2019, Vol. 35 ›› Issue (4): 448-454.DOI: 10.12116/j.issn.1004-5619.2019.04.014
吴泽1,2, 陈天发2, 曾志凡2, 张义为1, 汤真1, 苏开元1, 范辰韵1, 李士林1
WU Ze1,2, CHEN Tian-fa2, ZENG Zhi-fan2, ZHANG Yi-wei1, TANG Zhen1, SU Kai-yuan1, FAN Chen-yun1, LI Shi-lin1
摘要: 目的 分析苏州市吴江地区男性汉族人群Y染色体STR和SNP的基因分型,探索吴江地区人群的遗传结构,以进一步发掘具有该地区特异性的Y-SNP遗传标记祖先单倍群。 方法 随机采集472名吴江地区汉族男性个体的血样,采用YfilerTM Plus PCR扩增试剂盒进行基因分型,通过直接计算法得出各基因座的等位基因频率和单倍型频率,用Y-Predictor软件推测各样本的Y-SNP单倍群,并通过扩增阻滞突变系统聚合酶链反应(amplification refractory mutation system-polymerase chain reaction,ARMS-PCR)进行实验验证。 结果 472名吴江地区汉族男性群体的27个Y-STR遗传标记中,共检出453种单倍型,单倍型多样性(haplotype diversity,HD)为0.997 696 93,其中基因多样性(gene diversity,GD)值最高的是DYF387S1a/b(0.953 1)、最低的是DYS438(0.321 8)。根据472个样本27个Y-STR的基因分型数据,推测并实验验证得到来自C、D、N、O和Q等单倍群下游的132种单倍群。 结论 本研究基于Y染色体STR单倍型,通过Y-Predictor软件预测Y-SNP单倍群并利用ARMS-PCR进行验证,引入Y-SNP遗传标记,实现了对吴江地区3个镇区人群男性家系的精细遗传结构解析。