法医学杂志 ›› 2020, Vol. 36 ›› Issue (3): 316-325.DOI: 10.12116/j.issn.1004-5619.2020.03.005
王秋月, 杨以文, 曹悦岩, 朱强, 黄雨果, 胡渝涵, 周怡君, 李茜, 尉艺凡, 舒潘寅, 王玉芳, 张霁
WANG Qiu-yue, YANG Yi-wen, CAO Yue-yan, ZHU Qiang, HUANG Yu-guo, HU Yu-han, ZHOU Yi-jun, LI Xi, WEI Yi-fan, SHU Pan-yin, WANG Yu-fang, ZHANG Ji
摘要: 目的 筛选并构建与目前STR数据库兼容的SNP-STR遗传标记复合扩增体系,调查其在四川汉族群体中的遗传多态性,并探讨其在混合DNA样本分析中的应用价值。 方法 以现有商业试剂盒中使用的STR遗传标记为基础,筛选与STR遗传标记相邻的SNP位点并组成SNP-STR遗传标记。运用SNP等位基因设计特异性引物,构建基于等位基因特异性扩增的SNP-STR遗传标记复合扩增体系。调查该体系在四川汉族群体的遗传多态性,并评价不同位点数目的体系对两个体混合DNA样本的检测效能。 结果 筛选并构建了由13个SNP-STR遗传标记构成的等位基因特异性复合扩增体系。在四川汉族群体中,各位点杂合度为0.76~0.88,累积个体识别率达0.999 999 999 999 999 968。在对两个体混合DNA的分析中:单位点扩增时,混合样本的混合比例达到1 000∶1时依然可以检测到少量成分所特有的分型;多位点复合扩增时,混合比例最大可达500∶1;随着体系中位点数量的增加,对混合DNA中少量成分的检测效能降低。 结论 SNP-STR遗传标记较STR具有更高的多态性,其构成的复合扩增体系对混合样本的分析效能优于传统的STR复合扩增体系。