法医学杂志 ›› 2020, Vol. 36 ›› Issue (6): 755-761.DOI: 10.12116/j.issn.1004-5619.2020.06.003
翟豪杰,林伟,田甜,刘敏
ZHAI Hao-jie, LIN Wei, TIAN Tian, LIU Min
摘要: 目的 基于气相色谱-质谱法(gas chromatography-mass spectrometry,GC-MS)代谢组学技术筛选大 鼠骨骼肌挫伤后血清生物标志物,建立支持向量机(support vector machine,SVM)回归模型推断骨骼肌挫伤 时间。 方法 60只健康SD大鼠随机分为实验组(50只)、对照组(5只)和验证组(5只)。实验组及验证组 大鼠采取自由落体方法建立骨骼肌损伤模型,实验组大鼠分别于伤后0、2、4、8、12、24、48、96、144、240 h处 死,验证组大鼠于伤后192 h处死,对照组大鼠常规饲养3 d后处死。取骨骼肌行常规苏木精-伊红(hematoxylin-eosin,HE)染色,利用GC-MS获得血清代谢物谱图,应用正交偏最小二乘判别分析(orthogonal partial least square-discriminant analysis,OPLS-DA)模式识别方法对数据进行判别分析并筛选生物标志物,建立 推断损伤时间的SVM回归模型。 结果 代谢组学方法初步筛选出31种生物标志物,在此基础上进一步选 出6种生物标志物,但该6种生物标志物的相对含量随损伤时间变化的规律欠佳。根据6种生物标志物和 31种生物标志物数据均能成功建立SVM回归模型,且以31种生物标志物数据建立SVM回归模型推断的损伤 时间[(195.781±1.629)h]比以6种生物标志物数据建立SVM回归模型推断的损伤时间[(55.344±7.485)h] 更加接近实际值。 结论 以代谢产物数据建立SVM回归模型有望用于骨骼肌挫伤时间推断。
中图分类号: