法医学杂志 ›› 2021, Vol. 37 ›› Issue (4): 539-545.DOI: 10.12116/j.issn.1004-5619.2020.500713
贾振军1, 高春芳1, 钱尊磊1, 刘卓1, 汤强2, 苑美青3
JIA Zhen-jun1, GAO Chun-fang1, QIAN Zun-lei1, LIU Zhuo1, TANG Qiang2, YUAN Mei-qing3
摘要: 目的 研发东亚人群中具有较高个体识别率及族源分析能力的SNP Panal。 方法 以耶鲁大学KIDD教授建立的55个SNP Panel和加利福尼亚大学戴维斯分校SELDIN教授建立的128个SNP Panel,共计170个SNP Panel(简称170 SNP Panel)为基础,收集其在东亚人群中的检测数据,计算SNP位点的遗传学参数,结合热图分析结果筛选出适合东亚人群的SNP位点,并检测部分藏族及汉族人群样本,运用STRUCTURE软件、主成分分析、热图分析等方法分析其用于族源推断的可能性。 结果 筛选出45个SNP组成的Panel(简称45 SNP Panel),其中SNP位点的遗传学参数平均值优于170 SNP Panel,与170 SNP Panel具有相同的族源分析及推断能力。 结论 在族源推断信息上,45 SNP Panel完全可以替代170 SNP Panel,达到相同的族源分析及推断能力。而在遗传学参数上,在东亚人群中45 SNP Panel优于170 SNP Panel,体现了其潜在的重要法医学应用价值。
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