法医学杂志 ›› 2013, Vol. 29 ›› Issue (5): 360-364.DOI: 10.3969/j.issn.1004-5619.2013.05.011
韦文滔1,2,王 鑫1,3,王冬梅1,田璐源1,王保捷1,庞 灏1,丁 梅1
WEI WEN-TAO1,2, WANG XIN1,3, WANG DONG-MEI1, TIAN LU-YUAN1, WANG BAO-JIE1, PANG HAO1, DING MEI1
摘要: 目的 调查中国朝鲜族群体中H19基因上游差异甲基化区(differentially methylated region,DMR)SNP及单倍型分布,为法医学应用及群体遗传学研究提供基础数据。 方法 收集中国朝鲜族101份无关个体血样和14份来自5个亲缘关系已知的两代家系血样,用PCR-循环测序、McrBC消化DNA后PCR方法检测H19基因上游DMR的SNP,并用亲源印记等位基因(parentally imprinted allele,PIA)分型法进行单倍型检测,再计算相关遗传学参数。 结果 在H19基因上游DMR 1 174 bp的目的基因扩增产物中,共检出13个SNP(rs10840167、rs2525883、rs12417375、rs4930101、rs2525882、rs2735970、rs2735971、rs11042170、rs2735972、rs10732516、rs2071094、rs2107425、rs4930098)和5种单倍型,有9个SNP属于高鉴别能力的遗传标记,其单倍型具有较高的个人识别率,单倍型平均基因多样性(GD)为0.714。应用McrBC酶消化基因组DNA的PIA分型法确定了家系子代样本的母源单倍型。 结论 H19基因上游DMR在中国朝鲜族群体中具有很高的遗传多态性,母源单倍型的确定进一步提高了印记基因的法医学鉴定效能。
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