Test and Evaluation of the Made-in-China Quick TargSeq Fully Integrated Automated On-site Rapid DNA Detection Instrument

doi:10.12116/j.issn.1004-5619.2023.530601

Abstract

Abstract:

Objective To verify the stability and accuracy of the made-in-China Quick TargSeq Fully Integrated Automated On-site Rapid DNA Detection Instrument （hereinafter referred to as Quick TargSeq DNA detection instrument） and evaluate its forensic application prospects. Methods A total of 74 blind samples provided by the expert group of Criminal Investigation Bureau of the Ministry of Public Security （4 individuals, 20 samples） and five participating institutions （54 samples） were used to test on 5 Quick TargSeq DNA detection instruments and the accompanying microfluidic chip cartridges. The results were compared with the known genotypes to calculate the samples’ detection rate and genotyping accuracy. Results The results of reproducibility obtained from 20 samples provided by the expert group on the 5 Quick TargSeq DNA detection instruments were all consistent with the known genotypes. The detection rate of the 74 samples was 100%, and the genotyping accuracy was 97.33%. Conclusion The Quick TargSeq DNA detection instrument has good stability and high genotyping accuracy.

Key words: forensic genetics, forensic DNA typing, rapid DNA analysis, short tandem repeat, ancestry inference

CLC Number:

Jun-ping HAN, Ying-xi WANG, Chao LIU, Feng LIU, Jin-rong GUO, Wei ZHU, Guang-feng TANG, Cai-xia LI, Xin WANG, Zhang-ping JIAO. Test and Evaluation of the Made-in-China Quick TargSeq Fully Integrated Automated On-site Rapid DNA Detection Instrument[J]. Journal of Forensic Medicine, 2024, 40(5): 461-467.

Figures/Tables 7

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单位	测试样本					专家组样本（人员）		合计
	人员			现场物证		专家组样本（人员）
	口腔拭子	唾液卡	血卡	血棉签	烟蒂	血卡	口腔拭子
合计	10	6	26	5	7	10	10	74
北京市公安局	0	2	4	1	3	2	2	14
天津市公安局	2	0	4	4	4	2	2	18
山西省公安厅	0	4	6	0	0	2	2	14
北京市公安局朝阳分局	6	0	4	0	0	2	2	14
山东省泰安市公安局	2	0	8	0	0	2	2	14

单位	测试样本					专家组样本（人员）		合计
	人员			现场物证		专家组样本（人员）
	口腔拭子	唾液卡	血卡	血棉签	烟蒂	血卡	口腔拭子
合计	10	6	26	5	7	10	10	74
北京市公安局	0	2	4	1	3	2	2	14
天津市公安局	2	0	4	4	4	2	2	18
山西省公安厅	0	4	6	0	0	2	2	14
北京市公安局朝阳分局	6	0	4	0	0	2	2	14
山东省泰安市公安局	2	0	8	0	0	2	2	14

样本类型	样本量	全集成成功率	检出率	自动分型准确率
合计	74	98.65（73/74）	100.00（74/74）	97.33（2 702/2 776）
人员样本	62	98.39（61/62）	100.00（62/62）	99.96（2 321/2 322）
现场物证	12	100.00（12/12）	100.00（12/12）	83.92（381/454）

样本类型	样本量	全集成成功率	检出率	自动分型准确率
合计	74	98.65（73/74）	100.00（74/74）	97.33（2 702/2 776）
人员样本	62	98.39（61/62）	100.00（62/62）	99.96（2 321/2 322）
现场物证	12	100.00（12/12）	100.00（12/12）	83.92（381/454）

基因座	等位基因个数	均值	中位数	标准差	最小值	最大值
D2S441	112	747.73	843.81	209.85	478.36	987.12
D5S818	122	820.43	913.43	184.49	500.00	999.07
D21S11	127	864.33	932.65	170.54	500.00	999.08
D16S539	124	825.36	903.75	181.20	500.00	993.82
D1S1656	130	853.05	924.36	167.73	292.19	987.05
TPOX	117	778.90	910.34	213.19	461.61	997.45
Amelogenin	117	805.68	921.34	210.20	500.00	998.37
D3S1358	119	804.74	891.01	193.96	492.88	999.57
D13S317	129	858.61	913.22	151.86	500.00	994.52
D7S820	123	830.60	933.28	191.04	476.18	994.96
D2S1338	127	839.51	921.02	175.68	487.64	996.10
D18S51	134	895.68	931.80	127.39	500.00	999.04
D19S433	131	860.10	916.12	152.84	481.85	998.11
D22S1045	121	789.61	862.76	180.08	500.00	999.18
D8S1179	129	890.78	956.34	154.24	500.00	999.19
vWA	129	843.13	896.33	153.64	500.00	981.94
TH01	114	766.47	909.97	220.12	475.50	999.38
D10S1248	133	879.40	922.05	131.27	500.00	997.81
D12S391	131	857.29	904.58	137.75	495.84	992.47
CSF1PO	120	820.97	936.43	204.85	500.00	998.31
FGA	134	892.00	952.42	152.48	479.09	999.71