法医学杂志 ›› 2021, Vol. 37 ›› Issue (3): 382-387,395.DOI: 10.12116/j.issn.1004-5619.2020.500102
王颖希1, 马原2, 李甫3, 焦章平1
WANG Ying-xi1, MA Yuan2, LI Fu3, JIAO Zhang-ping1
摘要: 目的 评估基于高通量测序平台研发的SeqType P52人类祖先识别SNP检测试剂盒对中国5个民族的区分效能。 方法 基于高通量测序平台检测SeqType P52人类祖先识别SNP检测试剂盒,对来自中国汉族、藏族、蒙古族、维吾尔族、彝族共计350份样本进行检测和族群聚类分析。 结果 单个样本单个位点有效测序深度≥720×,平均检出率96%。藏族、蒙古族、维吾尔族、彝族4个民族和汉族的群体间等位基因频率差均值分别为0.20、0.05、0.24和0.11。在Structure 2.3.4 K=5模式下可以检测到汉族、藏族和维吾尔族比较独立的祖先成分,这与主成分分析(pricipal component analysis,PCA)结果相一致。对于彝族,其2/3拥有相对独立的与藏族人群接近的祖先成分,1/3成分和维吾尔族相似。蒙古族则拥有与汉族人群相似的祖先来源成分。 结论 本研究筛选并建立的52个祖先信息SNP位点复合检测体系能够有效地实现汉族、藏族、维吾尔族人群的成分构成和个体遗传成分的分析,对汉族、蒙古族、彝族3个民族区分能力还有待提高。SeqType P52人类祖先识别SNP检测试剂盒可以用于法医DNA部分案件中个体祖先的来源推断。
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